Коллекционный фонд Ботанического сада МКОУ Шубинской СОШ  состоит из следующих частей

1. Гербарные коллекции, в том числе  гербарий сосудистых растений, гербарий и коллекции водорослей.
2. Фондовые коллекции: дендрологическая ( образцы древесины деревьев, кустарников);   коллекция экономической ботаники (образцы растений, используемых человеком, а также продукты и изделия, изготовленные из них).

3.Коллекции открытого  и закрытого  грунта.

Коллекционные фонды являются основным инструментом исследования биологического разнообразия растительного мира.  Они позволяют исследовать распределение организмов на той или иной территории, а также проводить их мониторинг, отмечая их миграции, исчезновение. Ботанический сад  является важнейшей базой междисциплинарных исследований. Примером уже проводимых исследований является комплексная инвентаризация биологического разнообразия и  особо охраняемых природных территорий.   Помимо научного, сохранение и поддержание коллекционного фонда имеет и общекультурное значение, несет в себе экологическое воспитание.

На данный момент в питомнике выращиваем саженцы дуба, яблони, мандарина, каштана.